Divadlo Hybernia sídlí v domě U Hybernů, který vznikl spojením původně gotického kostela svatého Ambrože a sousedního františkánského kláštera. Po dlouhou dobu sloužil dům U Hybernů k výstavním účelům, avšak po rozsáhlé rekonstrukci, která skončila v roce 2006, byl uzpůsoben pro potřeby divadla. V současné době se zde konají převážně muzikálová představení a koncerty populární hudby.