V místech dnešního paláce se ve 14. století nacházela řada měšťanských domů, z nichž jeden patřil Petru Parléřovi a jiné jeho synům. V 16. století (mnoho z domů na parcele v předchozím století shořelo nebo bylo opuštěno) byl na místě postaven velký dům se zahradami. Ten patřil Šlikům, po nich Kinským a poté Lobkovicům. Poslední Trčkové z Lípy do něj přesídlili poté, co svůj palác na Malé Straně prodali Albrechtovi z Valdštejna.
Po roce 1634 palác získali Trauttmansdorffové, kteří původně renesanční budovu přestavěli ve stylu raného baroka a kteří palác vlastnili do počátku 19. století. Z paláce se poté stal klasicistní činžovní dům. V roce 1833 zde byla zřízena tzv. donucovací pracovna (měla přimět k pravidelné práci osoby práce se štítící nebo vedoucí nespořádaný život), která zde byla do čtyřicátých let 20. století, a od roku 1872 byla v části objektu věznice. V současnosti objekt využívá Ministerstvo zahraničních věcí České republiky .